Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP3K13O43283 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms