Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF839A8K0R7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms