Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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