Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8B2A6NJW9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms