Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms