Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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