Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GY05 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GY05 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms