Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP8A1Q9Y2Q0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms