Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POMPQ9Y244 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms