Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms