Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN2Q9UHV9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms