Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA9Q9UGM1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms