Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HIGD1BQ9P298 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms