Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms