Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms