Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms