Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms