Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms