Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBA1CQ9BQE3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms