Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms