Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF12Q99081 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms