Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COG8Q96MW5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms