Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms