Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARF2Q96GP6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms