Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SGF29Q96ES7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SGF29Q96ES7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SGF29Q96ES7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGF29Q96ES7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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