Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4CQ96CF2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms