Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC35B4Q969S0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms