Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC9Q8TBE3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms