Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF397Q8NF99 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms