Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DTX3Q8N9I9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.5 ms