Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms