Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms