Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms