Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms