Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL17Q6TDP4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms