Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms