Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIF1Q5T3J3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms