Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms