Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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