Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms