Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms