Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC0

ATP13A5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A5Q4VNC0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A5Q4VNC0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A5Q4VNC0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms