Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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