Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms