Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR6A1Q15406 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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NR6A1Q15406 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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NR6A1Q15406 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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NR6A1Q15406 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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