Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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