Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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