Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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