Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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