Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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